祖国医学虽然没有子宫内膜异位症这个病名，但对“痛经” 的描述却和子宫内膜异位症相似。中医认为“痛经”的原因是由喜﹑怒﹑忧﹑思﹑悲﹑恐﹑惊七情所伤，肝气郁结﹑气滞血瘀，或者经期受寒，邪正相搏结于腹中积聚而成。气滞血瘀是本病的主要病因，治疗原则则以活血化瘀为主，兼施他法。
治疗的方法有中药内服﹑外敷﹑灌肠﹑针灸等。中药内服法根据辨证施治的原则，将本病分成气滞血瘀证﹑气虚血瘀证﹑寒凝瘀阻证﹑热邪瘀阻证﹑肾虚血瘀证和阳虚血瘀证六大类分别治疗。活血化瘀的中药包括丹参﹑当归﹑川芎﹑蒲黄﹑延胡索﹑赤芍﹑血竭﹑桃仁﹑红花﹑没药﹑三棱﹑莪术等。这类药物可以促进腹腔内血块吸收﹑改善微循环﹑促进淋巴管吸收和免疫细胞的功能，还有消炎﹑抑菌和镇痛作用。
对单纯痛经﹑没有卵巢囊肿及不育的患者，可以选择中医中药治疗。手术后的一些患者也可以选择中药治疗预防复发。中医中药在子宫内膜异位症的治疗中有很好的应用前景，值得开发利用。
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